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? 腫瘤的復(fù)發(fā):微小殘留病灶MRD。在腫瘤患者接受治療后,盡管從影像學(xué)上似乎徹底清除了病灶,但仍有極少量未被檢測(cè)到的腫瘤細(xì)胞殘存或腫瘤細(xì)胞來(lái)源分子異常。這些殘存的腫瘤病灶被稱(chēng)之為微小殘留病灶(Minimal Residual Disease,MRD)或分子殘存病灶(Molecular Residual Disease)。MRD具有與原始腫瘤細(xì)胞相同或相似的表型和遺傳特征,可能仍擁有導(dǎo)致腫瘤復(fù)發(fā)的能力。
? 對(duì)MRD的檢測(cè):基于腫瘤的生物學(xué)和生理特征,腫瘤組織在代謝和增殖等生理過(guò)程中向循環(huán)系統(tǒng)釋放許多細(xì)胞或分子。用于血液瘤MRD檢測(cè)的主要生物標(biāo)志物是循環(huán)腫瘤細(xì)胞(Circulating Tumor Cells,CTC)。對(duì)于實(shí)體瘤,其通常將循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)和循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)釋放到體液中,但由于早期實(shí)體瘤很少釋放CTC到循環(huán)系統(tǒng)中,而ctDNA在所有階段的腫瘤中都會(huì)持續(xù)釋放,并且與腫瘤動(dòng)力學(xué)高度相關(guān),因此是目前用于實(shí)體瘤MRD檢測(cè)的主要標(biāo)志物。

? 基于癌癥特異性突變檢測(cè)ctDNA。ctDNA可以根據(jù)各種基因組特征進(jìn)行檢測(cè),包括癌癥特異性突變(cancer specific mutations)、甲基化、拷貝數(shù)變異(CNV)或ctDNA的其他特征等。癌癥特異性突變檢測(cè)是最常用于檢測(cè)ctDNA的基因組特征。
? NGS+定向檢測(cè):靈敏度和廣度的平衡。由于此前提到的在血液或體液整體cfDNA中,腫瘤相關(guān)ctDNA含量較低,因此使得癌癥特異性突變的頻率通常較低。最初基于ddPCR的方法BEAMing實(shí)現(xiàn)了較好的靈敏度,但可檢測(cè)突變數(shù)量十分有限?;贜GS的方法可以對(duì)患者樣本的大量DNA模板進(jìn)行高通量測(cè)序,但靈敏度較低,由于NGS錯(cuò)誤率導(dǎo)致罕見(jiàn)突變難以被檢測(cè)。因此將NGS與定向的檢測(cè)方法相結(jié)合能夠?qū)tDNA中的大量突變進(jìn)行多重檢測(cè),在保證廣度的同時(shí)也盡可能的提高了NGS檢測(cè)的靈敏度。近年來(lái)已被開(kāi)發(fā)的技術(shù)包括Safe-SeqS、Tam-Seq(基于PCR擴(kuò)增子的靶向NGS)、CAPP-Seq、PhasED-seq、MAESTRO(基于雜交捕獲的靶向NGS)等。

? Tumor-informed可能是更優(yōu)策略。目前基于ctDNA進(jìn)行MRD分析有兩種策略:Tumor-informed(依賴(lài)腫瘤組織信息)和Tumor-na?ve(與腫瘤類(lèi)型無(wú)關(guān)的固定Panel)。
? Tumor-informed策略:對(duì)患者原發(fā)腫瘤組織進(jìn)行WES測(cè)序,鑒定患者的特異基因組變異,定制化篩選、設(shè)計(jì)監(jiān)測(cè)Panel進(jìn)行個(gè)性化的ctDNA檢測(cè)分析。該策略可實(shí)現(xiàn)較高的靈敏度和特異性,個(gè)性化Panel可獲取患者攜帶的特有變異。但該方法需要足夠的腫瘤組織。此外,腫瘤中存在異質(zhì)性,因此Tumor-informed方法可能會(huì)由于組織樣本偏差而錯(cuò)過(guò)一些突變。Tumor-informed分析也無(wú)法追蹤隨訪(fǎng)期間出現(xiàn)的新克隆變異。
? Tumor-na?ve策略:固定化Panel,也稱(chēng)Tumor-agnostic,通過(guò)預(yù)先選定的引物/探針設(shè)計(jì)與癌癥類(lèi)型相關(guān)的panel,檢測(cè)ctDNA突變或甲基化等特征。該方法優(yōu)點(diǎn)為無(wú)須原發(fā)腫瘤組織,時(shí)間更快。缺點(diǎn)包括靈敏度可能較低,以及無(wú)法確定突變是否為腫瘤特異性還是其他來(lái)源(如CHIP)。

Natera:MRD產(chǎn)品適應(yīng)癥持續(xù)拓展并獲醫(yī)保納入
基于cfDNA檢測(cè)開(kāi)發(fā)系列產(chǎn)品。Natera成立于2004年,結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)和生物信息學(xué)分析打造了cfDNA技術(shù)平臺(tái),并開(kāi)發(fā)了系列產(chǎn)品,公司發(fā)展初期依靠無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)NIPT業(yè)務(wù)起步作為核心業(yè)務(wù),此后在MRD和移植監(jiān)測(cè)領(lǐng)域持續(xù)發(fā)力,2017年推出高精度和個(gè)性化MRD檢測(cè)產(chǎn)品Signatera,2019年推出Prospera腎移植評(píng)估測(cè)試,同時(shí)快速推進(jìn)臨床研發(fā)、擴(kuò)大病種應(yīng)用。2015年公司在納斯達(dá)克上市,2022年公司營(yíng)收8.20億美元。

測(cè)試量不斷提升,營(yíng)收保持高增長(zhǎng)。公司在過(guò)去十年不斷豐富三大業(yè)務(wù)線(xiàn)產(chǎn)品,推動(dòng)測(cè)試量增長(zhǎng),2022年公司年測(cè)試量已突破200萬(wàn)次。受測(cè)試量驅(qū)動(dòng)公司營(yíng)收快速增長(zhǎng),2022年?duì)I收8.2億美元,2014-2022營(yíng)收CAGR達(dá)22.7%。2017年之后隨著MRD和器官移植業(yè)務(wù)發(fā)展,毛利率從30%回升至50%左右。目前公司仍處于虧損狀態(tài),但虧損趨勢(shì)已有縮窄,2023年公司發(fā)布全年控費(fèi)計(jì)劃,預(yù)計(jì)在收入持續(xù)增長(zhǎng)和運(yùn)營(yíng)費(fèi)用減少的情況下,同步控制研發(fā)費(fèi)用和銷(xiāo)售及管理費(fèi)用,將總現(xiàn)金消耗減少約1.5億美元。

Signatera:Tumor-informed策略MRD檢測(cè)代表產(chǎn)品
Signatera?:Tumor-informed策略MRD檢測(cè)。2017年,公司推出Signatera RUO版本,基于ctDNA提供高靈敏度和個(gè)體化的MRD檢測(cè),當(dāng)時(shí)僅限癌癥研究人員和生物制藥公司用于研究使用;2019年,公司商業(yè)化發(fā)布Signatera,可在CLIA和CAP認(rèn)證實(shí)驗(yàn)室以L(fǎng)DT方式使用。2019到2021年Signatera獲得FDA授予3項(xiàng)突破性設(shè)備認(rèn)定。

“WES+個(gè)性化Panel”,監(jiān)測(cè)突變數(shù)量和靈敏度占優(yōu):Signatera采用“Tumor-informed”策略,通過(guò)每個(gè)患者組織樣本W(wǎng)ES檢測(cè)結(jié)果與正常組織或血液進(jìn)行對(duì)照,設(shè)計(jì)定制后續(xù)追蹤突變位點(diǎn)的個(gè)體化Panel進(jìn)行監(jiān)測(cè),報(bào)告是否檢測(cè)到循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA),并為縱向評(píng)估提供每毫升平均腫瘤分子數(shù)(MTM/mL),可監(jiān)測(cè)的突變數(shù)量多、靈敏度高。

? 適應(yīng)癥持續(xù)擴(kuò)展并被納入Medicare。自推出以來(lái)Signatera的適應(yīng)癥范圍持續(xù)拓展,且相繼被Medicare納入醫(yī)保報(bào)銷(xiāo)范圍。目前Medicare覆蓋范圍已經(jīng)包括了II、III期結(jié)直腸癌MRD監(jiān)測(cè)(2020年納入)、泛癌免疫治療療效監(jiān)測(cè)(2021年納入) 、肌肉浸潤(rùn)性膀胱癌MRD監(jiān)測(cè)(2022年納入)和IIB期及以上乳腺癌MRD監(jiān)測(cè)(2023年納入)四大方向。醫(yī)保納入擴(kuò)展產(chǎn)品應(yīng)用的市場(chǎng)空間,目前Signatera針對(duì)Ⅱ-Ⅳ期結(jié)直腸癌、泛癌免疫治療療效監(jiān)測(cè)、肌肉浸潤(rùn)性膀胱癌、IIB期及以上乳腺癌監(jiān)測(cè)可覆蓋的Medicare報(bào)銷(xiāo)人群分別為120萬(wàn)、80萬(wàn)、40萬(wàn)和100萬(wàn),總?cè)巳哼_(dá)340萬(wàn)。
? 腫瘤檢測(cè)業(yè)務(wù)快速放量:根據(jù)公司披露,截至目前已有超過(guò)30%的美國(guó)腫瘤專(zhuān)家訂購(gòu)Signatera,新客戶(hù)數(shù)量持續(xù)增長(zhǎng),2022年腫瘤檢測(cè)量達(dá)19.6萬(wàn)次,2023年上半年已超15萬(wàn)次,在各項(xiàng)腫瘤MRD的使用率均有上升。

積極推進(jìn)臨床試驗(yàn),數(shù)據(jù)支撐醫(yī)保納入。CMS的Palmetto MolDX項(xiàng)目在建議將某項(xiàng)檢測(cè)納入醫(yī)保之前通常會(huì)先公布LCD(localcoverage determination),可以看到LCD會(huì)突出已發(fā)表的文章情況,例如將Signatera檢測(cè)結(jié)直腸癌MRD納入醫(yī)保時(shí),MRD結(jié)果的高靈敏度,以及和無(wú)復(fù)發(fā)生存期的相關(guān)性被著重強(qiáng)調(diào)。目前,公司Signatera產(chǎn)品已在結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌、膀胱癌、多發(fā)性骨髓瘤、食管癌等十余種癌癥開(kāi)展臨床試驗(yàn)并獲得陽(yáng)性結(jié)果,預(yù)測(cè)癌癥復(fù)發(fā)的整體敏感性在88%-100%,特異性在98%-100%。醫(yī)保覆蓋工作有望持續(xù)推進(jìn)。

未來(lái)展望:癌種持續(xù)拓展,臨床數(shù)據(jù)讀出推動(dòng)指南納入和醫(yī)保覆蓋
癌種持續(xù)拓展,推動(dòng)指南納入。目前,公司Signatera產(chǎn)品已在結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌、卵巢癌、膀胱癌、多發(fā)性骨髓瘤、食管癌等十余種癌癥開(kāi)展臨床試驗(yàn),預(yù)測(cè)癌癥復(fù)發(fā)的整體敏感性在88%-100%,特異性在98%-100%。部分已被納入報(bào)銷(xiāo)范圍的癌種如結(jié)直腸癌和乳腺癌,對(duì)于不同亞型及不同試驗(yàn)類(lèi)型的臨床也正陸續(xù)開(kāi)展,通過(guò)多項(xiàng)前瞻性和RCT試驗(yàn)進(jìn)一步獲取臨床證據(jù),有望推動(dòng)指南納入和醫(yī)保覆蓋。
